1、环境因素的改变，例如进气温度、进气压力、湿度、水温对离心式空压机效率的冲击较大，甚至会影响离心式空压机到完全不能使用的地址，选购离心式空压机需要更周详的规划来弥补此项缺陷。

 2、以目前的市场区隔，离心式空压机仍然不适合低风量 (100HP以下)、高压 (50kg /cm2以上)的用途。

 3、构造虽然简单但是非常精密，维修人员的技术层次要远高于往复式空压机，因此维修人员必须经过相当的养成训练才能承担精密部份的维修工作（并非指例行的保养工作）。

 4、用于高转速的轴封气密性无法达到100％，因此不适合空气或氮气以外的任何气体压缩。

 5、在静止中（备用）的离心式空压机一旦遭受压缩空气系统的逆流将会反转，如果油泵也在静止中，会有因为共油而严重损坏的风险，因此，操作人员要养成良好的习惯，将静止中的空压机的出口阀关闭以根绝仅靠逆止阀来保护空压机的风险。

 6、离心式空压机与定排量式空压机有截然不同的压缩特性，操作人员要有离心式空压机的基本概念以防止离心式空机独具的气窒现象（Surge），连续性旳气窒很可能会造成空压机严重的损坏，修复的费用相当可观。

 7、不能使用变速控制。

 8、电力系统频率不同的地区，离心式空压机完全不可以移地使用（即使可以更换齿轮箱内部的机件，所花费的成本也相当高，很可能不如购买新机）。同理，在电力系统频率不稳定的地区选购离心式空压机要特别的慎重。